南通目前有3所本科大学、6所专科大学，单看数量已经高于多数的地级市，但毕竟可惜的是南通的三所本科学校中公办大学只有一所。
南通的9所学校分别是：
南通大学（本科）
南通理工学院（本科）
南通大学杏林学院（本科）
江苏工程职业技术学院（专科）
南通职业大学（专科）
南通科技职业学院（专科）
江苏航运职业技术学院（专科）
江苏商贸职业学院（专科）
南通师范高等专科学校（专科）
尽管南通的高校数量主要以专科为主，但对比其他省份，江苏在专科院校中的投入力量明显更高，各学校的就业情况也都很好。十几万的年轻大学生更是巨大的人才潜力，这也是很多高校匮乏的地区所不具备的优势。
